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Oct 07, 2023

Genomi di sei virus che infettano gli archaea di Asgard dalle profondità

Nature Microbiology volume 7,

Nature Microbiology volume 7, pagine 953–961 (2022) Citare questo articolo

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Gli archaea di Asgard sono microrganismi procarioti distribuiti a livello globale legati agli eucarioti; tuttavia, non sono stati descritti virus che infettano questi organismi. Qui, utilizzando sequenze di metagenoma recuperate da sedimenti idrotermali di acque profonde, caratterizziamo sei genomi virali di DNA a doppio filamento (dsDNA) relativamente grandi (fino a 117 kb) che hanno infettato due phyla archaeali di Asgard, Lokiarchaeota e Helarchaeota. Questi virus codificano per proteine ​​strutturali simili a Caudovirales, nonché per proteine ​​distinte da quelle descritte nei virus archeologici noti. I loro genomi contengono circa l'1-5% dei geni associati ai virus a DNA nucleocitoplasmatico eucariotico a grandi dimensioni (NCLDV) e sembrano essere capaci di replicazione semi-autonoma del genoma, riparazione, modifiche epigenetiche e regolazione trascrizionale. Inoltre, i virus Helarchaeota possono dirottare i sistemi di ubiquitina dell’ospite simili ai virus eucariotici. L'analisi genomica di questi virus Asgard rivela che contengono caratteristiche sia dei virus procariotici che eucariotici e fornisce informazioni sulla loro potenziale infezione e sui meccanismi di interazione con l'ospite.

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Articoli ad accesso aperto che citano questo articolo.

Accesso aperto a Nature Communications, 29 dicembre 2022

Nature Microbiology Accesso aperto 27 giugno 2022

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Le sequenze genomiche associate allo studio sono state depositate in NCBI sotto BioProject PRJNA692327.

Tutti gli script personalizzati, gli allineamenti e i file dell'albero filogenetico sono stati resi disponibili su https://github.com/bakermicrolab/asgardviruses.

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